Το Υ/Β ΚΑΤΣΩΝΗΣ αποτελεί το τρίτο Υ/Β στην ιστορία Ελληνικού Ναυτικού με αυτό το όνομα.

Η Ονομασία του Υ/Β ΚΑΤΣΩΝΗΣ ανάγεται στην προεπαναστατική περίοδο της Ελλάδας. Πιο συγκεκριμένα, δόθηκε προς τιμήν του θαλασσομάχου και Αξιωματικού του Αυτοκρατορικού Ρωσικού στρατού, Λάμπρου Κατσώνη (1752 – 1804) ο οποίος με πολεμική μοίρα που δημιούργησε ο ίδιος καταναυμάχησε τον τουρκικό στόλο στις ελληνικές θάλασσες και εκτέλεσε επιδρομές σε παράκτια τουρκικά οχυρά με ορμητήριά του την Κέα και το Πόρτο Κάγιο της Μάνης.

Το πρώτο υποβρύχιο (Y-1), ναυπηγήθηκε στην Τουλόν της Γαλλία κατά τα έτη 1924-1927 όπου το καλοκαίρι του 1927 παραδόθηκε στο Ελληνικό Ναυτικό  με πρώτο Κυβερνήτη τον Αντιπλοίαρχο Κωνσταντίνο Αρβανίτη ΠΝ. Έλαβε μέρος στις επιχειρήσεις του Β’ Παγκοσμίου Πολέμου σε διάφορες αποστολές και βυθίστηκε στις 14 Σεπτεμβρίου 1943 ανοιχτά της Σκιάθου.

Το δεύτερο υποβρύχιο (S-115), ναυπηγήθηκε στις ΗΠΑ το 1945 (πρώην USS Remora). Στις 25 Οκτωμβρίου 1973 παρελήφθηκε από το Ελληνικό Ναυτικό και στις 31 Μαρτίου 1993 παροπλίστηκε.

Το Υ/Β ΚΑΤΣΩΝΗΣ (S-123) είναι το τέταρτο υποβρύχιο τ.214, κλάσεως «ΠΑΠΑΝΙΚΟΛΗΣ», ενώ αποτελεί το τρίτο Υ/Β που ναυπηγήθηκε στα ναυπηγεία Σκαραμαγκά στο πλαίσιο του προγράμματος «ΑΡΧΙΜΗΔΗΣ». Η Ύψωση της Σημαίας έγινε την 14 Απριλίου 2014 και η τελετή ονοματοδοσίας την 23 Ιουνίου 2016 στα ναυπηγεία Σκαραμαγκά παρουσία της πολιτικής και στρατιωτικής ηγεσίας.